CDS
Accession Number | TCMCG066C19462 |
gbkey | CDS |
Protein Id | XP_034595023.1 |
Location | join(18679596..18679700,18679780..18679957,18680437..18680565,18686637..18686810,18689322..18689558,18690326..18691870,18691980..18694531,18694653..18695048,18695508..18695666,18696133..18696645,18696735..18696870,18697422..18697566,18698930..18699065) |
Gene | LOC117856748 |
GeneID | 117856748 |
Organism | Setaria viridis |
Protein
Length | 2134aa |
Molecule type | protein |
Topology | linear |
Data_file_division | PLN |
dblink | BioProject:PRJNA633601 |
db_source | XM_034739132.1 |
Definition | piezo-type mechanosensitive ion channel homolog isoform X3 [Setaria viridis] |
EGGNOG-MAPPER Annotation
Sequence
CDS: ATGCATCGGTTGAATGGGTCACTTCTTGTGTTCATTCTGCTCTGGGCAGCCAGCACGTATGTCTTCAATGTGGCATTCACGTTCTTCAACAAAAGATTTCAAAAGGATATGAAAGTTTGGGAGACTGTTGGGCTTTGGCACTATTCTATTCCTGGATTATTTTTACTTGCCCAATTCTGCCTTGGAGTCTTTGTAGCACTGTGTAATCTTGTTAACAATTCTGTTTTCCTTTACGTGAATCCTAAGGGTGGTCCTTCCTCAAGTGATGATCAGCTCATTGATGAGAAGGAAGATACGATGGTTCTGATTGTTGCAACACTAGCATGGGGTCTACGCAAGCTTTCACGTGCAATAACTTTAACATTACTCTTTCTGCTTGTGATGAAACGGGGATTTATTCATGCTGTTTACATGTGCTTTTTCCTGGTGTTTTTGGTGAATCATTCAATCGACAAGAGACTACGCCAGATCTTAGTATTGTTCTGCGAGGTTCATTTTTCAATATTATACATTCTTCAGCTTGAGCTAGTGTCCAGTGCTCTGGAGCGCAGTGGTTCATTAACAATGGAGGTACTCTCACAGTTAGGTCTCTCAAATAATGCCACAACAAAGGACTTCGTAGGGATAGGCTCAATAGTGTGCTTCTGCGCTGTGCATAGTCATGGTTTTAAGATGCTCTTTTCACTATCAGCAGTTCTGCGGCACACACCTTCTCCACCTGTTGGATTCACAATTCTTAAGGCTGGTTTGAACAAGTCAGTTCTATTATCAGTTTATAGTTCGCAAAATTCGCGAAATGATGAAGACCGCCGTAATTCACATGAGAAAAAAATTGCATCATATCTCAGTAAAATTGGTCAGAAATTTCTGTCAGTGTACCGTTCATATGGAACTTATGTGGCTTTTCTGACAATTCTTTTGACTCTATACTTGGTGACCCCTAATTATATATCATTTGGTTACCTGTTTTTCCTTCTATTTTGGATAATTGGAAGGCAGCTTGTGGAAAAGACAAAAAGGCGACTGTGGTTTCCGCTAAAAGTATATGCCGCGGTGGTTTTTATCTTTACCTACAGCCTGAGTGTTTCACCGATCTTTGCACAATTAGTCTCAAAGTTTGTTAAACTATATCCTGATCTGGGATTTGACCCTGAAGCTTCTTTGTTGGAAAATGTTTGGCAATCATTGGCTGTTCTAGTGGTAATGCAACTTTACAGCTATGAACGAAGGCAAAATAGTGACAAGAACTTTGGTGTATCTGATGCTTCGGAATCTGGACTTCTGGGGTTCCTAAGAAGATTTCTGATTTGGCACAGTGATAAGATATTATCAGTTAGTGTCTTTTATGCTTGCCTATCATCCATCAGTTTATCTGGCCTAATTTACCTGTTAGGCCTCATTGTGTTTTGTATGTTACCAAAAGTTTCTCGAATTCCTTCAAAGGTTTACCTTGTCTACACTGGTTTACTTGCTGCATCTGAATATCTTTTTCAAATGGTGTGCAAACCTGCACGAATGTGTCCTGATCAGCACTTCTATGGCTTGTCTGTGTTTCTTGGTCTGAAATATTATGATTCTGGGTTTTGGGGTGTTGAATATGGGCTTAGGGGAAAAGTTTTGGTGATTGTGGCCTGCACCATTCAGTATAATGTTTTCCATTGGTTAGATTTGATGCCAACATCTCTGGTACATAATGGTAAATGGGAAGAGCCCTGCCAGCTGTTTATCTCATCCAATTCACCTTATAGTCCTGTGAGAAGCAATGAAGCAAGTCATTCATCAAATAGGTTTACTTCGCTGTTTTCTAAAGTTCAAGGTCTTATAGGTAGCAGCTCCAGTTCATCTCTGGGTCTAGGCAACACTTCCCAGAAATCAGAGTATGTTGATAATGCCATCAAAGGTTCAGATGTGGACAAAAGATACTCCTTTGCAAAGATTTGGGGATTGTCAAAAGAAAGTCACAACTGGGATAAGAAAAGAATTATTTCTCTGAAAAGAGAAAGATTTGAAACTCAGAAAATAACATTCAAATGTTACATGAAGTTCTGGATAGAAAATCTTTTCAAACTGCGAGGTCTGGAAATTAACATGATTGTGTTATTATTGGCAAGCTTTACATTGTTGAATGTGGTATCGATCTTCTATATTGTGTGCCTCGTAGTCTGCATTCTTATGAACAGAGATCTAATCCAGAAAGTGTGGCCCCTTTTTGTATTTCTGTTTGCTTCTGTCCTAATACTCGAATATTTTGCTCTTTGGAACGATGTGATGCCTTGGTTTCATGATATCAATGACATTGAAGTCAATTGCCGTGAATGCTGGAAGAATTCAAGGATTTTCTTTGACTACTGCTCAAAATGCTGGCTCGGGATAACTGTCGATGACCCTCGAATGCTGATTAGCTACTACGTTGTGTTTATATTTTCCTCTTTTAAGCTTCGCTCAGACCGCTTCTCAGTCTTCTCAGACTCAGATACATATCGCCAGATGATGTCCCAAAGGAAAAATGCAGTAGTTTGGAGGGACCTCTCATTGGAAACAAAAAGCTTTTGGACATTTCTTGACTATGTACGGCTTTATGCTTATTGCCATTTATTAGACATAGTTTTGGCATTAATCGCTATCACCGGTACACTAGAGTATGATGTTCTGCACCTTGGCTACCTTGGATTTGCTCTGGTTTTCTTTAGAATGAGACTTGAAATATTGAAGAAGAAGAATAAGATTTTCAAGTATTTAAGGATGTATAATTTTGCTCTCATTGTTTTGTCACTTGCCTATCAATCTCCTTATGTTGGGCAGTTTAGTTCTGGCATGTGTGATCAAATTGACTACCTGTATGAAATAATTGGATTCTACAAGTATGACTACGGTTTTAAGATAACATCACGGTCAGCTTTTGTTGAAATAGTGATCTTCCTATTGGTGTCTGTTCAATCCTACATCTTTAGCTCTGGTGAGTTTGATTATGTGTCAAGATACCTTGAAGCAGAGCAAATTGGTGCTATGGTCCGCGAGCAGGAAAAAAAAGCTTTAAAGAAAACCGAGCAGCTGCAGCATCTTCGCAGGTCTGAGGAGCATAAACGTCAGCGGAACATGCAAGTGGAGAGGATGAAGTCTGAGATGTACAATTTACAAAGTCAGCTTAACAGAATGAACTCTTTCACGCCAATAAATGATACATCACACAATGAGGGCCTGAGGCGGAGGAGGAATACTAAGCTGTATAGCGATACTGATACCCTACATGAAGATAATGAGACTGGATCACCAACAAAGCAAGATAAGATTGGAAGCACAGAGTCAGCAGAGTCCTTTGAATTTTCTATAGCAGATACACAGAAGAACATGAGAGATTTGATGTTCCAGCACTCATCTGATACTATGAGATCACCAATCAGGGGGAGAAGTGACGAATTTGTGCTCACTGATAATATTAGAAATTCCCTGGGTTCGACACCTGAGATCACTGAGTTTGAGGAGAGTGATGAAAAAGTTAATTATAATTTATCCAAATGGGAGAAGGCAAGGGGACAACCTAAGGAAAACCCACTAAAATCAGCTGTACAATTGATTGGTGATGGTGTCTCCCAAGTTCAGTCATTTGGAAACCAGGCAGTCACAAATATTGTTAGCTTCTTGAACATTGATCCAGATGAACCACACTCCAATGAGCATCCTGCAGAAGGTGACATTTATGATGTTGTTGAAAGTCAGACAGAAACACAAGATGGGCAGCTGCCGAGAACACATTCAGTTTCAGACACCTCAGGGACTAAAGTGAAATCAAGCATGCCAATTGGTGTGATCTTTCGGTATATATGGTATCAGATGCGAAGTAATTATGATTATGTTTGCTATTGCTGTTTTGTTCTGGTTTTTTTGTGGAATTTTAGTTTGCTATCCATGGTGTACCTTGGGGCACTTTTCTTATATGCTCTTTGTGTGAACTATGGCCCAAGTTACTTGTTTTGGGTCATCATTCTGATATACACTGAGCTCAACATTCTGTCACAGTACATATATCAGATTATCATTCAGCACTGTGGTTTGAATATACATTTATCACTTCTCCAGAGATTAGGTTTCCCTGTCGATAAAATAAAGGCATCGTTTGTTGTCAGCATATTGCCTCTCTTTTTAGTCTATATATCCACTCTCTTGCAGAGCTCTATTACTGCCAAAGATGGTGAATGGGTTCCGGTAACAGAATTCAGTTTTCTCAGCACAAGAAACAACATTGAAGAGAAACGCTGTATCCCTTACAGTTGGAGAGAGAGGCTAAAAAGTTTGCACTTGCCCATAATGAATCTCTTAAGGATGATCATTAGAGGCTTATCTAGATATTGGATGTCATTAACACATGGAGCAGAATCGCCACCATATTTTGTGCAAGTTACAATGGAGGTAAACCATTGGCCAGAAGATGGAATCCAGCCAGAGAGGATAGAGTCAGCCATAAATAGGGTGCTTGCTATTGCACATGAAGAAAGATGCCAGGCTAACTTGCCTGCCTCTTGCCACTGTTGTAGCAAAGTCCGGATTCAAAGTATTGAGAAAAGCAAAGAAAATTCTAATATGGCTCTTGCTGTACTAGAAGTTGTTTACGCTGCTCCTTTAGAATGCCAACCAGCAGGATGGTACAAATCACTCACTCCAGCAGCTGATGTAGAAAGGGAGATTCATGAGTCACAGAAAGCTGGACTTTTTGATGAAATAAATTTTCCTTACCCAATTGTCTCAGTGATAGGTGGGGGTAAAAGAGAGATCGATCTTTACGCATATTATTTTGGTGCTGACCTGGCAGTTTTCTTCCTTGTTGCGATGTTCTATCAATCTGTCCTAAAAAATAAGAGTGAGTTTTTGGAAGTTTACCAGCTGGAGGATCAGTTCCCGAAAGAATTTGTATTCATCTTAATGGTTCTCTTTTTCTTAATAGTGGTTGACCGCATTATATATCTATGGTCCTTTGCCACCGGGAAAGTTGTTTTCTATCTTTTTAACCTTGTGCTTTTCACATATTCAGTCACTGAATATGCTTGGGGAATGGAGTTAGCTCACAGGGATGTTGGAGGACTTGTACTACGTGCTATCTACCTTACAAAATCAATTTCCCTAGCACTGCAGGCATTACAGATCAGATATGGCATTCCAAACAAGAGCAACTTATATAGACAATTCTTGACTAGCAAAGTAACACAAGTGAATTACTTGGGCTTCCGGCTGTATCGAGCTTTACCATTCTTGTATGAATTGCGGTGTGTGCTTGATTGGTCTTGCACAACCACATCATTAACCATGTATGATTGGCTAAAGTTGGAGGACATATATGCAAGCTTGTTTCTTGTGAAATGCGATGCAATTTTGAATAGAGCAAATCATCGACAAGGAGAAAAGCAAACAAAACTGACAAAGTTCTGTAGTGGGATATGCTTATTCTTTGTACTTATTTGTGTTATTTGGGCTCCTATGTTGATTTACAGTAGCGGTAATCCTACAAATATTGCCAACCCTGTTATTGATGTAAGTATTAAGATTGATATAAAGGCACTTGGTGGAAGATTAACCTTGTTTAAGACCACCGCTTGTGAAAAAATACCCTGGAAGTACTTGAAGGCCTACGGTGATGTTGATCCTCTAGGTTACCTAGGGGCATATAATGTCGATGACATTCAGCTGATTTGCTGTCAACCTGATGCATCAACAATGTGGTTGATACCTCCTCCAGTCCAAAGCAGATTTATCCAATCCCTTGGGAGAGAAACACTTTTTGAAAAGATGGAACTTATTTTAAATTGGGATTTTCTCAGAGCTCGACCAAAAGGGAAGGAATTAGTGCGATATGAATCCCCTATTGAACACTGCCCGAGTGTAGATGATGTTAAACAAGTGCTTAATGGAACTACAAACAGCTTCAGCATAATTGATGCTTACCCTAGGTACTTTCGGGTTACTGGATCAGGTGAAGTTCGACGACTAGAAGCAGCGATAGATTCAGTAAGTGGTGAACTGCTATTGAATAATGGTACTTCTTGGTGGTCATTCTATACAAACCCCTCAGATTTGGCAGGCTGTCAAGGGTTGAATGGTCCCATGGCCATAGTTGTGTCTGAGGAGACACCTCAGGGCATTATTGGTGAAACACTCAGCAAATTTAGCATATGGAGTTTATACATTACTTTTGTTTTAGCTGTTGCAAGATTTATTAGGCTGCAGTGCTCAGACTTGAGAATGAGAATACCATATGAGAATCTTCCATCTTGTGACAGGCTACTCGACATCTGTGAAGGCATTTATGCAGCAAGAGCTGAAGGCGAGTTAGAAGTGGAAGAAGTCCTATATTGGACATTGGTAAACATATACAGATCACCACATATGCTGCTTGAATACACAAAACCTGACTAG |
Protein: MHRLNGSLLVFILLWAASTYVFNVAFTFFNKRFQKDMKVWETVGLWHYSIPGLFLLAQFCLGVFVALCNLVNNSVFLYVNPKGGPSSSDDQLIDEKEDTMVLIVATLAWGLRKLSRAITLTLLFLLVMKRGFIHAVYMCFFLVFLVNHSIDKRLRQILVLFCEVHFSILYILQLELVSSALERSGSLTMEVLSQLGLSNNATTKDFVGIGSIVCFCAVHSHGFKMLFSLSAVLRHTPSPPVGFTILKAGLNKSVLLSVYSSQNSRNDEDRRNSHEKKIASYLSKIGQKFLSVYRSYGTYVAFLTILLTLYLVTPNYISFGYLFFLLFWIIGRQLVEKTKRRLWFPLKVYAAVVFIFTYSLSVSPIFAQLVSKFVKLYPDLGFDPEASLLENVWQSLAVLVVMQLYSYERRQNSDKNFGVSDASESGLLGFLRRFLIWHSDKILSVSVFYACLSSISLSGLIYLLGLIVFCMLPKVSRIPSKVYLVYTGLLAASEYLFQMVCKPARMCPDQHFYGLSVFLGLKYYDSGFWGVEYGLRGKVLVIVACTIQYNVFHWLDLMPTSLVHNGKWEEPCQLFISSNSPYSPVRSNEASHSSNRFTSLFSKVQGLIGSSSSSSLGLGNTSQKSEYVDNAIKGSDVDKRYSFAKIWGLSKESHNWDKKRIISLKRERFETQKITFKCYMKFWIENLFKLRGLEINMIVLLLASFTLLNVVSIFYIVCLVVCILMNRDLIQKVWPLFVFLFASVLILEYFALWNDVMPWFHDINDIEVNCRECWKNSRIFFDYCSKCWLGITVDDPRMLISYYVVFIFSSFKLRSDRFSVFSDSDTYRQMMSQRKNAVVWRDLSLETKSFWTFLDYVRLYAYCHLLDIVLALIAITGTLEYDVLHLGYLGFALVFFRMRLEILKKKNKIFKYLRMYNFALIVLSLAYQSPYVGQFSSGMCDQIDYLYEIIGFYKYDYGFKITSRSAFVEIVIFLLVSVQSYIFSSGEFDYVSRYLEAEQIGAMVREQEKKALKKTEQLQHLRRSEEHKRQRNMQVERMKSEMYNLQSQLNRMNSFTPINDTSHNEGLRRRRNTKLYSDTDTLHEDNETGSPTKQDKIGSTESAESFEFSIADTQKNMRDLMFQHSSDTMRSPIRGRSDEFVLTDNIRNSLGSTPEITEFEESDEKVNYNLSKWEKARGQPKENPLKSAVQLIGDGVSQVQSFGNQAVTNIVSFLNIDPDEPHSNEHPAEGDIYDVVESQTETQDGQLPRTHSVSDTSGTKVKSSMPIGVIFRYIWYQMRSNYDYVCYCCFVLVFLWNFSLLSMVYLGALFLYALCVNYGPSYLFWVIILIYTELNILSQYIYQIIIQHCGLNIHLSLLQRLGFPVDKIKASFVVSILPLFLVYISTLLQSSITAKDGEWVPVTEFSFLSTRNNIEEKRCIPYSWRERLKSLHLPIMNLLRMIIRGLSRYWMSLTHGAESPPYFVQVTMEVNHWPEDGIQPERIESAINRVLAIAHEERCQANLPASCHCCSKVRIQSIEKSKENSNMALAVLEVVYAAPLECQPAGWYKSLTPAADVEREIHESQKAGLFDEINFPYPIVSVIGGGKREIDLYAYYFGADLAVFFLVAMFYQSVLKNKSEFLEVYQLEDQFPKEFVFILMVLFFLIVVDRIIYLWSFATGKVVFYLFNLVLFTYSVTEYAWGMELAHRDVGGLVLRAIYLTKSISLALQALQIRYGIPNKSNLYRQFLTSKVTQVNYLGFRLYRALPFLYELRCVLDWSCTTTSLTMYDWLKLEDIYASLFLVKCDAILNRANHRQGEKQTKLTKFCSGICLFFVLICVIWAPMLIYSSGNPTNIANPVIDVSIKIDIKALGGRLTLFKTTACEKIPWKYLKAYGDVDPLGYLGAYNVDDIQLICCQPDASTMWLIPPPVQSRFIQSLGRETLFEKMELILNWDFLRARPKGKELVRYESPIEHCPSVDDVKQVLNGTTNSFSIIDAYPRYFRVTGSGEVRRLEAAIDSVSGELLLNNGTSWWSFYTNPSDLAGCQGLNGPMAIVVSEETPQGIIGETLSKFSIWSLYITFVLAVARFIRLQCSDLRMRIPYENLPSCDRLLDICEGIYAARAEGELEVEEVLYWTLVNIYRSPHMLLEYTKPD |